根据病史和体征不难诊断。首先应详细询问病史，了解有无周期性的疼痛，于视诊时可发现肛门缘有裂痔，但急性肛裂可无裂痔。用手将肛门缘皮肤轻轻向两侧分开，可见裂口下端。如用探针轻触裂口的部位即可引起疼痛。指检时因肛门括约肌痉挛、肛门收缩，强行插入会引起疼痛，因此而明确诊断，就不必再作直肠指诊或肛门镜检查，以免增加病人的痛苦。必须检查时可用棉签浸泡1％的地卡因放入肛内，局部作表皮麻醉几分钟后再作检查。指诊时可摸到肛门裂口，急性肛裂多边高、底浅，触之敏感；慢性肛裂则边硬、底深，无弹性。肛门镜检查，可见椭圆形或梭形溃疡。急性肛裂则边缘整齐，底红色；慢性肛裂则边缘不齐，底深灰白色。
鉴别诊断：
1．肛门皮肤皲裂：多由肛门瘙痒症、肛门湿疹等继发引起，裂口表浅而短，不到肛管，疼痛轻而出血少，瘙痒较重，无溃疡、裂痔和肛乳头肥大等并发症。
2．肛门结核：溃疡形态不规则，边缘潜行，疼痛轻，无裂痔，在做病理检查时可见结核结节和干酪样坏死病灶。
3．肛门皮肤癌：溃疡形态不规则，表面凹凸不平，边缘隆起，质硬，并有奇臭味和持续疼痛，病理切片可见癌细胞。